Actualización de Terminología Genética

¿Por qué es importante seguir los consensos?

Existen múltiples materiales de referencia, tanto bases de datos, como guías e informes. Es importante que todos usemos un mismo conjunto de términos para asegurar que las diferentes informaciones sean compatibles y que todos entendamos lo mismo. Cuando alguien lea un informe de farmacogenética y necesite consultar una guía o un artículo, es esencial que se usen las mismas palabras y con el mismo significado. De lo contrario, podrían surgir errores o confusiones.

Se han realizado grandes esfuerzos de estandarización dentro de la comunidad científica, y Eugenomic siempre ha procurado adoptar aquellos conceptos que tienen suficiente consenso. Estos cambios van a mejorar la comprensión del trabajo de los diferentes profesionales a largo plazo.

¿A qué afectan estos cambios?

Los cambios afectan tanto al software g-Nomic como a los informes de farmacogenética. No implican ningún cambio en la metodología de análisis ni a los resultados genéticos en sí mismos, pero sí que puede variar la terminología con la que nos referimos a estos resultados, o a la clasificación de fenotipos Metabolizadores.

Listado de los cambios (explicación detallada más adelante):

• Añadimos el fenotipo Metabolizador Rápido
• El Activity Score 0,5 pasa de ser considerado de PM a IM
• Para CYP2C9, el Activity Score 0,5 se mantiene como PM, y el Activity Score 1,5 pasa de ser NM a ser IM
• Para CYP2B6 todas las variantes de actividad disminuida pasan a tener el mismo peso que las de actividad nula
• Cambiamos los nombres con que nos referimos a los fenotipos de CYP3A5: NM pasa a ser PM (normal) y UM pasa a ser NM (aumentado)

Incorporación del fenotipo Rapid Metabolizer (RM)

En esta actualización empezarán a informarse resultados con fenotipo Rapid Metabolizer RM.

¿Qué es el fenotipo RM?

Las personas con actividad superior a la normal, solían ser clasificadas con el fenotipo Metabolizador Ultrarrápido (UM).

Sin embargo, esta forma de clasificación no admite ninguna gradación entre un Metabolismo normal y un Metabolismo realmente muy aumentado. El fenotipo RM sirve de puente entre las personas con fenotipo Metabolizador Normal (NM) y con Metabolizador Ultrarrápido (UM).

Asignamos el fenotipo RM a las personas que son portadoras de una única variante genética de aumento de actividad, mientras que la otra copia es normal. Cuando la persona tiene ambas copias del gen con variantes de aumento de la actividad, se le sigue denominando UM.

¿Qué genes pueden tener el fenotipo RM?

Actualmente los principales genes de Metabolismo que tienen variantes de aumento de actividad son CYP1A2, CYP2B6 y CYP2C19.

Hay que tener en cuenta que para el gen CYP2D6 existen variantes que aumentan la actividad, pero en este caso el aumento es tan drástico que, para este gen, incluso las personas portadoras de una sola variante de actividad aumentada se consideran con fenotipo UM.

Umbrales de Activity Score

¿Qué es el Activity Score?

El Activity Score (AS), o puntaje de actividad, se refiere a una puntuación numérica asignada a un gen o alelo específico para cuantificar su nivel de actividad metabólica. Este puntaje se basa en la función y la actividad de ese gen o alelo en el Metabolismo de ciertos fármacos.

El AS puede ser utilizado para clasificar a las personas en diferentes fenotipos metabólicos, dependiendo de la actividad enzimática medida por el AS.

• Metabolizadores Normales (MN)
• Metabolizadores Intermedios (IM)
• Metabolizadores Pobres (PM)
• Metabolizadores Rápidos (RM)
• Metabolizadores Ultrarrápidos (UM)

Tanto nuestro software de farmacogenómica gNomic, como nuestros informes de farmacogenética han estado empleando un umbral en el que un valor de Activity Score igual o inferior a 0,5 era considerado Metabolizador Pobre (PM). Sin embargo, el consenso actual dictamina que únicamente el Activity Score 0 se considere Metabolizador Pobre.

Esto quiere decir que las personas que para un gen tenían un Activity Score de 0.5, y que habían sido clasificadas como Metabolizadoras Pobres (PM) a partir de ahora, se considerarán Metabolizadoras Intermedias.

Activity Score: Genes actualizados

CYP2C9

La mayoría de genes tienen los mismos umbrales de Activity Score, pero CYP2C9 tiene sus propios umbrales ligeramente más laxos.

Mientras que un AS de 1,5 se considera normal (NM) para la mayoría de genes, para CYP2C9 se considera suficientemente bajo para clasificarse como IM. Además, un AS de 0,5 se considera PM en lugar de IM.

Hasta ahora el software g-Nomic ha estado usando los umbrales generales, pero a partir de ahora pasarán a usarse los umbrales tal como salen en las guías.

CYP2B6

El gen CYP2B6 tiene variantes de actividad disminuida y variantes con actividad nula. Las guías actuales no distinguen entre los dos tipos de actividad, y las consideran todas igual que la actividad nula.

Por lo tanto, algunas personas que tengan variantes de actividad reducida posiblemente se clasifiquen de forma más desfavorable. Por ejemplo, algunas personas que habían sido clasificadas como Metabolizadoras Normales, pasarán a clasificarse como Metabolizadoras Intermedias, y algunas personas que se habían clasificado como Metabolizadoras Intermedias ahora se clasificarán como Metabolizadoras Pobres.

Esto permite mayor sensibilidad en la detección de personas con riesgo de efectos adversos y facilita la implementación de las guías.

CYP3A5

Se considera que la persona que tiene actividad metabólica nula es un Metabolizador Pobre y la que tiene plena actividad es un Metabolizador Normal.

Sin embargo, en el caso del CYP3A5, 9 personas de cada 10, tienen actividad nula.

Tener actividad metabólica (fenotipo Metabolizador Normal) es absolutamente excepcional, y estas personas pueden tener problemas de eficacia porque tienen mayor metabolismo de lo previsto. Para resolver esta situación, en Eugenomic decidimos llamar a la falta de actividad, Metabolizador Normal, y a las personas con actividad, las llamamos Metabolizador Ultrarrápido, con el objetivo de transmitir mejor las repercusiones del genotipo.

Sin embargo, con el tiempo han sido otras nomenclaturas las que han tenido mayor aceptación y han acabado en las guías. Por este motivo, se ha decidido unificar la nomenclatura con los nombres de referencia, y, por lo tanto:

• Las personas sin actividad se llamarán Metabolizadoras Pobres (se especificará entre paréntesis que la actividad es normal respecto a la mayoría de la población)
• Las personas con actividad se llamarán Metabolizadoras Normales (se especificará entre paréntesis que la actividad es aumentada respecto a la mayoría de la población)

Este cambio no afecta en absoluto a cómo se clasifican las personas, ni en las alertas y recomendaciones proporcionadas por g-Nomic; solo es un cambio visual en el nombre que se les da.

Si laboratorios, clínicos y autores de guías y otros recursos de referencia utilizamos todos los mismos criterios y los mismos nombres, simplificaremos el uso de los recursos disponibles, evitaremos errores, y facilitaremos el trabajo de nuestros profesionales.

¿Tienes dudas? Podemos ayudarte.

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